在中央生态环保督察指出长江豚类自然保护区内持续进行违规开垦的问题后，江苏省镇江市委、市政府高度重视，主要领导多次批示，市纪委监委坚决问责，及时全面拆除“大江风云”等违规项目，全面停止农业生产活动和水产养殖活动。
经过人工覆土和生态自然恢复等修复措施，整改区域的植被覆盖率显著增加，鸟类种类和数量明显增多，江滩湿地生态环境明显改善。如今的保护区已经是蒹葭苍苍、绿树如茵、水天一色、鸥鹭齐翔。
大江风云实景园——整改前
大江风云实景园——整改后
以督察整改为契机，镇江市深入贯彻落实习近平生态文明思想，强化“生态优先、绿色发展”的思想自觉和行动自觉，积极探索江豚保护长效机制，呵护好一方生态。
配套完善监测站、巡护艇、无人机、高清监控等保护区管理设施，优化移动监管平台，提高现场定位核实能力，建立水陆空立体监测网络。持续开展保护区水生生物资源本底和生物多样性调查，加强保护区内长江江豚等生物资源监测和水域生态监控。组织开展保护区遥感监测评估，及时发现违法违规建设活动并督促整改到位。镇江市政府督查办、市纪委市监委、市生态环境部门、市自然资源等部门强化督察合力，严肃查处失职、渎职等行为。
实施长江渔业资源放流，累计投入各项放流资金2900余万元，放流各类苗种1.85亿尾。通过开展增殖放流、修复水生植被、建设人工鱼巢、生态浮岛等生态修复措施和保护区常年禁渔执法管理，保护区内渔业资源逐渐稳定，水域生态环境明显改善。
江豚保护区江豚
以镇江长江珍稀水生动物展览馆、江豚保护区自然学校、江豚保护主题月、全国大学生江豚保护夏令营、江豚保护科普宣传活动等为载体，多途径向公众宣传保护水生野生动物相关知识。利用电视、报纸、网络等媒体，不断拓展自然保护宣教阵地，营造全社会推进长江大保护的良好氛围。
出台《关于进一步加强江苏镇江长江豚类省级自然保护区管理工作的意见》，建立豚类保护区综合管理联席会议制度，形成多部门联合、跨区域协作的管理模式；出台《镇江市生态红线区域保护规划》，对豚类自然保护区实行分级分类管理；建立健全巡护管理工作制度，制定水生野生动物救护应急预案；市级财政统筹部、省、市各级专项资金，强化项目监督管理和绩效评价，支持豚类保护区建设和日常运行。