最新公布的第二次全国污染源普查结果显示，农村和西部地区环保基础设施相对全国或东部地区滞后，需要进一步加大投资力度。
从“一污普”到“二污普”的十年间，化肥、农药使用量实现了连续三年负增长，农村卫生厕所普及率提高近25%，畜禽粪污综合利用率达到75%，秸秆综合利用率达到85%，农膜回收率达到80%。
从时间的维度纵向来看，农村绿色发展的数据是喜人的。这与生态环境、农业农村等部门坚持把绿色发展摆上突出位置，加快转变农业发展方式，加强农业污染防治和农村人居环境整治是分不开的。
但是，从空间的维度进行全国横向比较可以发现，农村环保设施滞后依然是一个亟待解决的问题。
与“一污普”相比，“二污普”时期全国环境污染治理投资从3387.30亿元增至9538.95亿元，增长近两倍，其中城镇环境基础设施建设投资由1467.50亿元增至6085.75亿元，占比由43.32%增至63.80%，提高了20.48%。但同时也应看到，乡村环境基础设施建设投资占比依然偏低，投入相对不足。农村生态环境不欠新账、逐步还旧账的压力依然很大。以农业源种植业中用到的地膜为例，“一污普”公报数据中地膜残留量为12.10万吨；而到了“二污普”，地膜多年累积残留量增至118.48万吨。
农村环境污染有其自身的特点。相对于集中排放且总量大的工业污染源而言，农村生活污水、无组织倾倒的垃圾、不合理使用的农药、化肥农业品等污染物处理量小、分布相对分散，因而容易被忽略，但是产生的面源污染和无组织排放给治理和监管增加了难度。在一些农村地区，环保设施建设滞后，已建成设施的运行维护资金短缺，处理能力不足。
在我国西部一些农村地区，环保设施和环境治理能力滞后的短板更加明显。我国幅员辽阔，高海拔和低海拔地区、山区和平原地区、内陆和沿海地区，在地形、气候、水文等方面有着不同的环境特点。西部地区相对东部地区地理环境更加复杂多样，这就给污染治理设施建设增加了难度。在东部较发达、低海拔地区常用的污染治理设施在西部环境中无法充分发挥作用，需要选择合适的、有针对性的处理工艺，这就需要相应增加投入。而这些地区的总体经济实力相对有限，基础设施建设和后续的运行维护都面临现实难题。
日益突出的农村环境问题如果不加以妥善解决，将会影响整体环境质量。补齐农村生态环境治理短板，缩小西部与全国和东部地区的差距，首要的就是加大投入，支持农村和西部环境基础设施建设。
在资金筹措方面，应将农村和西部污染治理设施建设投入纳入财政预算，从政策制度层面加以保障。创新涉农资金使用方式，对以往分部门、分项目筹措资金的渠道探索进行统筹整合，合理保障农村人居环境基础设施建设和运行资金需求。善用市场机制为资金筹措开拓渠道，调动社会各界参与环境整治的积极性。明确污染处理设施项目建设和监管的主体责任，建立起政府主导、乡镇实施、部门监管、群众自筹、社会参与的资金统筹机制，保障经费来源有稳定的渠道。创新政府支持方式，采取以奖代补、先建后补、以工代赈等多种方式，充分发挥政府投资的杠杆作用，提高资金使用效率。
在资金使用方面，提质增效的关键是“把好钢用在刀刃上”，用专项资金解决重点问题。对水污染物排放贡献比较大的农业源污水问题、百姓身边的人居环境问题等，应成为重点投入的方向。资金投入向贫困落后地区、西部地区适当倾斜，让农村贫困人口从农业农村污染治理攻坚战中受益。
农村和西部的自然条件、污染状况和经济特点千差万别，环境治理没有放诸四海皆准的统一模式。为了确保资金投入能够取得实实在在的成效，需因地制宜选择符合当地实际、经济适用的污染治理工艺和技术，采用多样化的治理模式。还需注意的是，环保投入应保持持续和连贯。比如，不仅要加大设施建设方面的投入，还要保障设施运营维护和技术升级的资金需求。同时，加强技术人员培训等软件投入，确保建成的环保设施能稳定运行，持续发挥作用，切实增强污染治理能力。